Introduction
La super-famille des metallo-β-lactamase constitue une très ancienne famille d'enzymes avec un large spectre de substrats comme les acides nucléiques (ADN et ARN) ou les peptides anti-microbiens. On distingue 2 familles parmi les metallo-β-lactamase qui agissent sur les ARN: RNase Z et β-CASP. Il a été démontré que chez Bacillus subtilis la protéine RNaseJ1 (sous-famille des β-CASP) est impliquée dans le métabolisme des ARN avec une activité endonucléase et exonucléase 5'-3'. Par recherche de similarité, une séquence orthologue à la Rnase J1 a été retrouvé chez une Archaea, Pyrococcus abyssi. L'objectif du TD est d'étudier la distribution taxonomique de la RNase J1 chez les Archaea.Séquence RNase J de Pyrococcus abyssi
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>Pyrococcus abyssi
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Exercice 1 : Création de l'échantillon d'étude
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Exercice 2 : Recherche de motifs dans les séquences |
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