CREATE DATABASE  IF NOT EXISTS `resistance` /*!40100 DEFAULT CHARACTER SET latin1 */;
USE `resistance`;
-- MySQL dump 10.13  Distrib 5.5.20, for Linux (x86_64)
--
-- Host: localhost    Database: resistance
-- ------------------------------------------------------
-- Server version	5.5.20

/*!40101 SET @OLD_CHARACTER_SET_CLIENT=@@CHARACTER_SET_CLIENT */;
/*!40101 SET @OLD_CHARACTER_SET_RESULTS=@@CHARACTER_SET_RESULTS */;
/*!40101 SET @OLD_COLLATION_CONNECTION=@@COLLATION_CONNECTION */;
/*!40101 SET NAMES utf8 */;
/*!40103 SET @OLD_TIME_ZONE=@@TIME_ZONE */;
/*!40103 SET TIME_ZONE='+00:00' */;
/*!40014 SET @OLD_UNIQUE_CHECKS=@@UNIQUE_CHECKS, UNIQUE_CHECKS=0 */;
/*!40014 SET @OLD_FOREIGN_KEY_CHECKS=@@FOREIGN_KEY_CHECKS, FOREIGN_KEY_CHECKS=0 */;
/*!40101 SET @OLD_SQL_MODE=@@SQL_MODE, SQL_MODE='NO_AUTO_VALUE_ON_ZERO' */;
/*!40111 SET @OLD_SQL_NOTES=@@SQL_NOTES, SQL_NOTES=0 */;

--
-- Table structure for table `organisme_mo`
--

DROP TABLE IF EXISTS `organisme_mo`;
/*!40101 SET @saved_cs_client     = @@character_set_client */;
/*!40101 SET character_set_client = utf8 */;
CREATE TABLE `organisme_mo` (
  `id` varchar(20) NOT NULL,
  `genre` varchar(45) DEFAULT NULL,
  `espece` varchar(45) DEFAULT NULL,
  `nom` varchar(45) DEFAULT NULL,
  PRIMARY KEY (`id`)
) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1;
/*!40101 SET character_set_client = @saved_cs_client */;

--
-- Table structure for table `image_plant`
--

DROP TABLE IF EXISTS `image_plant`;
/*!40101 SET @saved_cs_client     = @@character_set_client */;
/*!40101 SET character_set_client = utf8 */;
CREATE TABLE `image_plant` (
  `fichier` varchar(512) NOT NULL COMMENT 'nom du fichier image',
  `position` varchar(45) NOT NULL COMMENT 'position de la boite sur l''image en partant de 1 pour celle de gauche',
  `id_boite` int(11) DEFAULT NULL COMMENT 'code barre de la boite à cette position',
  `image_date` date DEFAULT NULL COMMENT 'date du fichier image',
  `jour` int(11) DEFAULT NULL COMMENT 'nombre de jours (15 ou 21)',
  PRIMARY KEY (`fichier`,`position`)
) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1;
/*!40101 SET character_set_client = @saved_cs_client */;

--
-- Table structure for table `mesures_plant`
--

DROP TABLE IF EXISTS `mesures_plant`;
/*!40101 SET @saved_cs_client     = @@character_set_client */;
/*!40101 SET character_set_client = utf8 */;
CREATE TABLE `mesures_plant` (
  `fichier` varchar(512) NOT NULL COMMENT 'nom du fichier d''image',
  `position_boite` int(11) NOT NULL COMMENT 'position de la boite sur l''image',
  `num_plant` varchar(45) NOT NULL COMMENT 'position de la plante dans la boite',
  `date_mesure` date NOT NULL COMMENT 'date de l''analyse d''image',
  `id_boite` int(11) DEFAULT NULL,
  `brunissement` float DEFAULT NULL COMMENT 'surface de brunissement de la racine',
  `R1` float DEFAULT NULL COMMENT 'surface de la racine principale',
  `brunissement_pc` float DEFAULT NULL,
  `cotyledons` float DEFAULT NULL COMMENT 'jaunissement des cotyledons',
  `plantes_mortes` int(11) DEFAULT '0',
  `R2` int(11) DEFAULT NULL COMMENT 'nombre de racines secondaires',
  PRIMARY KEY (`fichier`,`position_boite`,`num_plant`,`date_mesure`)
) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1;
/*!40101 SET character_set_client = @saved_cs_client */;

--
-- Table structure for table `organisme_pl`
--

DROP TABLE IF EXISTS `organisme_pl`;
/*!40101 SET @saved_cs_client     = @@character_set_client */;
/*!40101 SET character_set_client = utf8 */;
CREATE TABLE `organisme_pl` (
  `hapmap_id` varchar(5) NOT NULL,
  `lignee` varchar(7) DEFAULT NULL,
  `population` varchar(10) DEFAULT NULL,
  `pays` varchar(30) DEFAULT NULL,
  `categorie` varchar(30) DEFAULT NULL,
  `provenance_graines` varchar(50) DEFAULT NULL,
  `statut` varchar(20) DEFAULT NULL,
  PRIMARY KEY (`hapmap_id`)
) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1;
/*!40101 SET character_set_client = @saved_cs_client */;

--
-- Table structure for table `boite`
--

DROP TABLE IF EXISTS `boite`;
/*!40101 SET @saved_cs_client     = @@character_set_client */;
/*!40101 SET character_set_client = utf8 */;
CREATE TABLE `boite` (
  `id` int(11) NOT NULL COMMENT 'code barre de la boite',
  `id_manip` int(11) DEFAULT NULL COMMENT 'numéro de manip',
  `num_boite` int(11) DEFAULT NULL COMMENT 'numéro de la boite (par plante et par répétition biologique)',
  `id_pl` varchar(5) DEFAULT NULL COMMENT 'identifiant Hapmap de la plante',
  `repetition` int(11) DEFAULT NULL COMMENT 'numéro de la répétition biologique',
  `contamination` int(11) DEFAULT '0' COMMENT 'est-ce que la boite a été contaminée ?\n0 = non\n1 = oui',
  `innoculee` int(11) DEFAULT '1' COMMENT 'est-ce que la boite a été innoculée ?\n0 = non (en général boite n° 4)\n1 = oui',
  `poids_matiere_fraiche` float DEFAULT NULL COMMENT 'poids en g de l''ensemble des plants à 21j dans une boite',
  `quantite_mycelium` float DEFAULT NULL COMMENT 'quantité de mycélium dans les racines',
  PRIMARY KEY (`id`)
) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1;
/*!40101 SET character_set_client = @saved_cs_client */;

--
-- Table structure for table `manip`
--

DROP TABLE IF EXISTS `manip`;
/*!40101 SET @saved_cs_client     = @@character_set_client */;
/*!40101 SET character_set_client = utf8 */;
CREATE TABLE `manip` (
  `id` int(11) NOT NULL,
  `date_culture_mo` date NOT NULL COMMENT 'date de mise en culture du microorganisme',
  `date_sterilisation_pl` date NOT NULL COMMENT 'date de stérilisation des plantes',
  `date_production_zoospores` date DEFAULT NULL,
  `date_transfert_sur_boite` date DEFAULT NULL COMMENT 'date de transfert des plants sur boite',
  `date_innoculation` date DEFAULT NULL,
  `date_lecture_15j` date DEFAULT NULL,
  `date_lecture_21j` date DEFAULT NULL,
  `concentration_innoculat` int(11) DEFAULT NULL,
  `id_mo` varchar(20) NOT NULL DEFAULT 'ATCC201684' COMMENT 'identifiant du microorganisme',
  PRIMARY KEY (`id`)
) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1;
/*!40101 SET character_set_client = @saved_cs_client */;
/*!40103 SET TIME_ZONE=@OLD_TIME_ZONE */;

/*!40101 SET SQL_MODE=@OLD_SQL_MODE */;
/*!40014 SET FOREIGN_KEY_CHECKS=@OLD_FOREIGN_KEY_CHECKS */;
/*!40014 SET UNIQUE_CHECKS=@OLD_UNIQUE_CHECKS */;
/*!40101 SET CHARACTER_SET_CLIENT=@OLD_CHARACTER_SET_CLIENT */;
/*!40101 SET CHARACTER_SET_RESULTS=@OLD_CHARACTER_SET_RESULTS */;
/*!40101 SET COLLATION_CONNECTION=@OLD_COLLATION_CONNECTION */;
/*!40111 SET SQL_NOTES=@OLD_SQL_NOTES */;

-- Dump completed
