M2BBS - IDH
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** Intégration de données d'expression | ** Intégration de données d'expression | ||
** Intégration de données d'interaction protéine-protéine | ** Intégration de données d'interaction protéine-protéine | ||
Current revision as of 15:07, 27 August 2021
Introduction et présentation des différentes approches d'intégration
Durée : 1/2 journée
- Approches et généralités
- Analyses préliminaires sur les données d'E. coli : ppi.vs.coexp.html
Modélisation, représentation et construction d'une base de connaissances sur E. coli puis exploitation
Durée : 1 journée
- Prise en main de Neo4j et intégration des données sur le génome d'E. coli : Ecoli.knowledge.base.html
- Intégration de données d'expression
- Intégration de données d'interaction protéine-protéine
- Intégration de données phylogénomiques
- Gènes co-exprimés et interactions protéiques et lien de conservation du contexte génomique
- Recherche de caractéristiques sur-représentées
- Intégration de données d'annotation et recherche d'annotations sur-représentées chez les gènes/protéines partageant un lien de coexpression/interaction/phylogénomique
