TD2 Genome Selection Plantes
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* Rechercher les 2 séquences enregistrées sous les numéros d'accession NP_000624 et NP_000648 | * Rechercher les 2 séquences enregistrées sous les numéros d'accession NP_000624 et NP_000648 | ||
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* Comparer les séquences deux à deux, en utilisant une matrice de point (dotplot). Les logiciels sont disponibles dans la suite [http://vm-bioinfo.toulouse.inra.fr/emboss/ EMBOSS]. | * Comparer les séquences deux à deux, en utilisant une matrice de point (dotplot). Les logiciels sont disponibles dans la suite [http://vm-bioinfo.toulouse.inra.fr/emboss/ EMBOSS]. | ||
:Utiliser '''DOTPATH''' qui permet de dessiner un '''dotplot''' avec une taille de mot fixée. | :Utiliser '''DOTPATH''' qui permet de dessiner un '''dotplot''' avec une taille de mot fixée. | ||
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Revision as of 12:16, 28 September 2016
Objectifs
Exercice 1 : Comparaison de 2 séquences avec une matrice de point (dot plot)
- Rechercher les 2 séquences enregistrées sous les numéros d'accession NP_000624 et NP_000648
- Que pouvez vous dire sur ces 2 séquences ?
- Comparer les séquences deux à deux, en utilisant une matrice de point (dotplot). Les logiciels sont disponibles dans la suite EMBOSS.
- Utiliser DOTPATH qui permet de dessiner un dotplot avec une taille de mot fixée.
- Que pouvez-vous conclure ?
