TD4 Bioanalyse
From silico.biotoul.fr
OBJECTIFS DU TP
Comprendre le résultat du programme BLAST Utiliser un programme d'alignement multiple, et identifier des zones conservées, générer un Logo Ecrire une signature protéique (pattern) Rechercher dans une banque protéique des séquences qui possèdent cette signature
Ci-dessous une sélection des sites Internet qui vous seront nécessaires :
- EBI European Bioinformatics Institute (EMBL, GB)
- NCBI National Center for Biotechnology Information (NIH, USA)
- Expasy Expert Protein Analysis System (Swiss Institute of Bioinformatics, Suisse)
- PBIL Pôle Bio-Informatique Lyonnais (CNRS, Lyon)
- Phylogeny
- Génopôle Toulouse
Lors du TD3, vous avez étudiez le gène BCL2 humain. Nous allons maintenant chercher des homologues à ce gène, construire un alignement multiple et une signature protéique.
