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Introduction et présentation des différentes approches d'intégration

Durée : 1/2 journée

Modélisation, représentation et construction d'une base de connaissances sur E. coli puis exploitation

Durée : 1 journée

  • Prise en main de Neo4j et intégration des données sur le génome d'E. coli : Ecoli.knowledge.base.html
    • Intégration de données d'expression
    • Intégration de données d'interaction protéine-protéine
    • Intégration de données phylogénomiques
    • Gènes co-exprimés et interactions protéiques et lien de conservation du contexte génomique