From silico.biotoul.fr

Contents 1 BioMart 2 Confrontation des données : approche ensembliste 3 Priorisation 4 Données

BioMart

• Premier pas
  • Allez sur le site de l'EBI, puis sur BioMart pour récupérer les entrées du dataset Ensembl bacteria 14 d'Escherichia coli K-12.
  • Essayer différents filtres (ayant des termes GO, ou autre).
  • Sélectionner certains attributs.
  • Utiliser la fonctionnalité count puis results.

Confrontation des données : approche ensembliste

Priorisation

Données

• Media:M2BBS-IDH-gene.tar.bz2
• Media:M2BBS-IDH-go.tar.bz2
• Media:M2BBS-IDH-phyogenetic_profiles.tar.bz2
• Media:M2BBS-IDH-string.tar.bz2
• Media:M2BBS-IDH-transcriptome.BsubA.tar.bz2
• Media:M2BBS-IDH-transcriptome.EcolA.tar.bz2
• Media:M2BBS-IDH-transcriptome.PaerA.tar.bz2
• Media:M2BBS-IDH-biocyc.tar.bz2