M2R BV clonage cartes
From silico.biotoul.fr
(→Carte et MCS du plasmide pVX (Potato Virus X)) |
(→Séquence pBSK_CBEL, au niveau du MCS) |
||
| Line 4: | Line 4: | ||
| - | > | + | >pBSK_MCS_CBEL999 bp |
ctgcaaggcgattaagttgggtaacgccagggttttcccagtcacgacgttgtaaaacga cggccagtgagcgcgcgtaatacgactcactatagggcgaattgggtaccgggccccccc tcgaggtcgacggtatcgataagaca '''atg''' ATTGCTCGCATTACCGTAGTCTTCGCTGGTC TCGTAGCTGTCGTCTCTGGTgcctgctcgactccctcattcggcaactgtggctctgatg ctgccggcgtgagctgctgccagagcacgcagtactgccaaccttggaacgccaactact accagtgcctcgatctccctgctaaatgcgctcagcagttcccgaacgtcgacttcaatg gagacgacatccagaccatctacggcattcagcccggagaatgctgcacgcgctgcagcg agactgctggttgcaaggcctacaccttcgtgaacagcaatccgggccaaccggcgtgct acctgaagagcggcactggtacaaggacgccctcggttggagcagtctcgggcatcttga cgggaacgtcaacaaccccgacgccgaccccaacaatgacgccaacgccaacgccgacga catcatcgccaacctgcaccacggcaccgtatggctcctgtggctccagtaacggagcta cgtgctgcccgagcggctactactgccaaccatggaacgacagtttttaccagtgcatcc agccgccagcgaaatgctcgaaacaactcaccgacaaggactactacggcaacgacatta agaccgtctacgtgagcctcccgtcgctttgctgtgatgcctgtgctagcacggcaggat gcaaggcgtacacgtacatcaacaacaaccccggtcagcctgtgtgctacttgaagagcg ctgcgggaactgccaccaccaagatcggtgctgtgtcggggactctcaac''' taa''' gttgagacaggcggccgccaccgcggtggagctccagcttttgttc | ctgcaaggcgattaagttgggtaacgccagggttttcccagtcacgacgttgtaaaacga cggccagtgagcgcgcgtaatacgactcactatagggcgaattgggtaccgggccccccc tcgaggtcgacggtatcgataagaca '''atg''' ATTGCTCGCATTACCGTAGTCTTCGCTGGTC TCGTAGCTGTCGTCTCTGGTgcctgctcgactccctcattcggcaactgtggctctgatg ctgccggcgtgagctgctgccagagcacgcagtactgccaaccttggaacgccaactact accagtgcctcgatctccctgctaaatgcgctcagcagttcccgaacgtcgacttcaatg gagacgacatccagaccatctacggcattcagcccggagaatgctgcacgcgctgcagcg agactgctggttgcaaggcctacaccttcgtgaacagcaatccgggccaaccggcgtgct acctgaagagcggcactggtacaaggacgccctcggttggagcagtctcgggcatcttga cgggaacgtcaacaaccccgacgccgaccccaacaatgacgccaacgccaacgccgacga catcatcgccaacctgcaccacggcaccgtatggctcctgtggctccagtaacggagcta cgtgctgcccgagcggctactactgccaaccatggaacgacagtttttaccagtgcatcc agccgccagcgaaatgctcgaaacaactcaccgacaaggactactacggcaacgacatta agaccgtctacgtgagcctcccgtcgctttgctgtgatgcctgtgctagcacggcaggat gcaaggcgtacacgtacatcaacaacaaccccggtcagcctgtgtgctacttgaagagcg ctgcgggaactgccaccaccaagatcggtgctgtgtcggggactctcaac''' taa''' gttgagacaggcggccgccaccgcggtggagctccagcttttgttc | ||
| - | |||
==Carte et MCS du plasmide pVX (Potato Virus X) == | ==Carte et MCS du plasmide pVX (Potato Virus X) == | ||
Current revision as of 10:21, 14 September 2018
Séquence pBSK_CBEL, au niveau du MCS
Codon start et stop en gras, peptide signal en lettres capitales
>pBSK_MCS_CBEL999 bp
ctgcaaggcgattaagttgggtaacgccagggttttcccagtcacgacgttgtaaaacga cggccagtgagcgcgcgtaatacgactcactatagggcgaattgggtaccgggccccccc tcgaggtcgacggtatcgataagaca atg ATTGCTCGCATTACCGTAGTCTTCGCTGGTC TCGTAGCTGTCGTCTCTGGTgcctgctcgactccctcattcggcaactgtggctctgatg ctgccggcgtgagctgctgccagagcacgcagtactgccaaccttggaacgccaactact accagtgcctcgatctccctgctaaatgcgctcagcagttcccgaacgtcgacttcaatg gagacgacatccagaccatctacggcattcagcccggagaatgctgcacgcgctgcagcg agactgctggttgcaaggcctacaccttcgtgaacagcaatccgggccaaccggcgtgct acctgaagagcggcactggtacaaggacgccctcggttggagcagtctcgggcatcttga cgggaacgtcaacaaccccgacgccgaccccaacaatgacgccaacgccaacgccgacga catcatcgccaacctgcaccacggcaccgtatggctcctgtggctccagtaacggagcta cgtgctgcccgagcggctactactgccaaccatggaacgacagtttttaccagtgcatcc agccgccagcgaaatgctcgaaacaactcaccgacaaggactactacggcaacgacatta agaccgtctacgtgagcctcccgtcgctttgctgtgatgcctgtgctagcacggcaggat gcaaggcgtacacgtacatcaacaacaaccccggtcagcctgtgtgctacttgaagagcg ctgcgggaactgccaccaccaagatcggtgctgtgtcggggactctcaac taa gttgagacaggcggccgccaccgcggtggagctccagcttttgttc
Carte et MCS du plasmide pVX (Potato Virus X)
- La carte du vecteur pVX est présentée ci dessous
- La séquence du site multiple de clonage (MCS) du pVX en orientation 5'-3' est le suivant :
>pVX_MCS
TGATACTCGAAAGAGGTCAGCACCAGCTAGCATCGATTGGCGCGCCTGGAGCGGCCGCGT CGACCGCCGA TGAACGGTTA AGTTTCCATTGATACTCGAA
Soit les sites de restriction :
5’- ClaI- AscI-NotI-SalI -3’
