TD1 Bioanalyse
From silico.biotoul.fr
(Difference between revisions)
(Created page with '------------------------------------------------------- '''OBJECTIFS DU TP''' Etre capable de retrouver une séquence dont on connait le numéro d'accession dans sa banque …') |
|||
Line 1: | Line 1: | ||
------------------------------------------------------- | ------------------------------------------------------- | ||
- | + | =OBJECTIFS DU TP= | |
Etre capable de retrouver une séquence dont on connait le numéro d'accession dans sa banque | Etre capable de retrouver une séquence dont on connait le numéro d'accession dans sa banque | ||
Line 7: | Line 7: | ||
Naviguer entre les banques, changer de format, télécharger des séquences | Naviguer entre les banques, changer de format, télécharger des séquences | ||
----------------------------------------------------------- | ----------------------------------------------------------- | ||
+ | |||
+ | =EXERCICE 1 : Accéder à une séquence prédéfinie dans les banques= | ||
+ | |||
+ | '''1/''' Aller sur le site d'UniProt : chercher la séquence P01308. | ||
+ | |||
+ | *De quelle protéine s'agit-il ? chez quel organisme ? | ||
+ | *Quelle est la taille de cette séquence ? | ||
+ | *Que sont les "VARIANT" ? | ||
+ | *Y a-t-il des preuves expérimentales de l'existence de cette protéine ? | ||
+ | *Est-elle dans UniProt-trEMBL ou UniProt-SwissProt ? | ||
+ | *Dans quels processus intervient cette protéine ? Cliquer sur des liens de la GO et aller voir l'onglet Ancestor Chart |
Revision as of 08:41, 10 September 2016
OBJECTIFS DU TP
Etre capable de retrouver une séquence dont on connait le numéro d'accession dans sa banque Savoir comment s'organisent les fiches des séquences, et où y chercher les informations Etre capable de trouver une ou des séquences à l'aide de mots clés ciblant des champs spécifiques Naviguer entre les banques, changer de format, télécharger des séquences
EXERCICE 1 : Accéder à une séquence prédéfinie dans les banques
1/ Aller sur le site d'UniProt : chercher la séquence P01308.
- De quelle protéine s'agit-il ? chez quel organisme ?
- Quelle est la taille de cette séquence ?
- Que sont les "VARIANT" ?
- Y a-t-il des preuves expérimentales de l'existence de cette protéine ?
- Est-elle dans UniProt-trEMBL ou UniProt-SwissProt ?
- Dans quels processus intervient cette protéine ? Cliquer sur des liens de la GO et aller voir l'onglet Ancestor Chart