TD2 Genome Selection Plantes
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Revision as of 12:11, 28 September 2016
Objectifs
Comparaison de 2 sequences avec une matrice de point
- Sur le site du NCBI, recherchez les protéines codées par le gène BCL2.
- Combien en avez-vous ? Sélectionnez celles qui proviennent du génome humain.
- Restreindre la recherche aux séquences contenues dans la banque RefSeq.
- Vous devriez maintenant avoir au moins les 2 isoformes NP_000624 et NP_000648.
- Comparer les séquences deux à deux, en utilisant une matrice de point (dotplot). Les logiciels sont disponibles dans la suite EMBOSS.
- Utiliser DOTPATH qui permet de dessiner un dotplot avec une taille de mot fixée.
- Que pouvez-vous conclure ?
