Controle Continu 2015 2016
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Controle Continu Décembre 2015, Durée Examen 2h
Veuillez indiquez vos réponses sur la feuille d'examen. Pensez a indiquer vos noms et prénoms
En cas de souci, vous trouverez sur ce lien la version pdf de l'énoncé de l'examen
Exercice I
1) Combien de séquence protéique STE12 du champignon Colletotrichum higginsianum sont disponibles dans la base de données RefSeq du NCBI ?
2) Indiquez votre requête
3) On s'intéresse maintenant à la séquence KNG52032
- a) A quel organisme appartient cette séquence ?
- b) Quelle est la nature de cette séquence?
- c) Quelle est la fonction de cette séquence ?
- d) Schématisez l’architecture de cette séquence ?
Exercice II
Soit les séquences Seq1 et Seq2.
>SEQ1
CTCGAGTCTTGGCTCATTCTTCTTTCACTAGCCTGAACTGTTCCTTTTGCGTTACTTCTTGTCTCATACA TTCTGATACTGCGTATCAAGTCACTCTCTAAAGAAACAAGCAACCAATCATCACCACCACCAACAAACCA GCAAACATCTCTGCCAAGATGGTCTCTTACCTCTTCGTGCTCGGCGCCCTGGCTTCTGTTGCCATCGCCT CCCCCGTCCCCGAGCTCAAGGCCCGCGCCAGCTGCACCTTCACCGATGCTGCCTCTGCCATCAAGGGCAA GGCCAGCTGCACCACCATCGTCCTCAACAATATTGCGGTCCCTGCCGGCACCACCCTCGACATGACCGGC CTCAAGTCTGGCACTCACGTAAGTTTCTCTCTCTCTCTCAGTCTCATTATCTGTTCCTAGAGACATCCAC CAACACACCCTTCAACAGGTCACCTTCCAAGGCAAAACCACCTTCGGCTACAAGGAGTGGGAGGGCCCCC TCATCTCCTTCTCCGGCTCCAACGTCGTCATCGACGGCGCCTCCGGCCACTCCATCGACTGCCAGGGCTC CCGCTGGTGGGACTCCAAGGGCGGCAACGGCGGCAAGACCAAGCCCAAGTTCTTCTACGCCCACAGCCTC AAGGACTCGACCATCAGGGGCCTCCACACGCTCAACACCCCCGTCCAGGCCTTCTCCATCAACGGCGCCG CCAACCTCGGCGTCTACGACGTCTCCGTCGACAACTCGGCCGGCGACTCCGCCGGCGGCCACAACACCGA CGCCTTCGACGTCGGCTCCTCCACCGGCGTCTACATCTCTGGCGCCGACGTCAAGAACCAGGACGACTGC CTCGCCGTCAACTCGGGCACCAATATTACCTTCACCGGCGGCACCTGCTCCGGCGGCCACGGTCTTTCCA TCGGCTCCGTTGGCGGCCGCAAGGATAATGTCGTCAAGAGCGTCAGCATCACCAACTCCAAGATTATCAA CTCGGATAACGGCGTGCGTATCAAGACCGTGGCCGGCGCTACTGGTCCCGTTTCCGACATCACCTACTCG GGCATCACCCTCTCCAACATCGCCAAGTACGGCATCGTCATCGAACAGGACTACGAGAACGGTTCTCCCA CCGGCAAGCCCACCTCCGGTGTCCCTATTTCCGGCCTCACCCTCAGCAAGATCAGCGGTTCCGTCTCCTC CTCCGCCACCCCCGTTTACATCCTCTGCGCCTCCTGCACCAACTGGAAGTGGTCCGGCGTCAGCGTCACC GGCGGCAAGAAGTCCTCCAAGTGCACCGGTATCCCCAGCGGGAGCGGTGCTGCTTGCTAAGCGGCTGAGT CTTTACGCGCGGACTCGGGGTGAGCGCTCAATCTCTCACACCTATATAGGTACACACACAAACATACTGC GGACTTGGTCGGTCGACACACGGTCTCCGGGGCTAGTTTTCTCCCTTGAGGAGCACAAGACACCGCTCGC GGAGTGAAGCTGGACTGTCTTTCTTGTAATTAATTGGGTCCTGTCTGAGGTGTCCGTCCATCCCTCCCTG GGGATGCAAATATTTCCTGTATATATTTCCTTTACTCCCCTCGTCTCCTTCTTCGACGAGGGTGGTGGAA CAAACATAGCTTGATCCAAATTGATGTGCTTTGGACGCAATTTCGCTGCCGTCTTTCCCGTGCCGGTAAT CTACAAGGAACCGTGGTCTG
>SEQ2
TCGGCGCCCTGGCTTCTGTTGCCATCGCCTCCCCCGTCCCCGAGCTCAAGGCCCGCGCCA GCTGCACCTTCACCGATGCTGCCTCTGCCATCAAGGGCAAGGCCAGCTGCACCACCATCG TCCTCAACAATATTGCGGTCCCTGCCGGCACCACCCTCGACATGACCGGCCTCAAGTCTG GCACTCACGTAAGTTTCTCT
1) Quel type d’alignement pouvez-vous faire pour comparer ces 2 séquences ? Expliquez.
2) Quelle(s) hypothèse(s) vous pouvez faire sur la nature de ces 2 séquences ?
3) À quoi correspond le pourcentage de similarité ?
4) La séquence seq1 est-elle codante ? Si oui, quelle est la fonction de la protéine associée ? Expliquez.
Exercice III
Récupérer la séquence CAA65843.1.
1) Représentez l’architecture de cette séquence.
2) A quoi correspond le lien croise ‘db_xref="InterPro:IPR000177’ ?
3) Les données sur cette séquences ont–elles été validées par un annotateur expert ? Justifiez votre réponse
Exercice IV
La séquence ci-dessous est-elle codante ? Expliquez votre démarche et indiquez la fonction de la protéine déduite.
>SeqInconnue
CGACGCATCAGATCAAGTTCCTCCTTACTCCACCCTAGAGTTTCTCAAGACAATGATTGC TCGCATTACCGTAGTCTTCGCTGGTCTCGTAGCTGTCGTCTCTGGTGCCTGCTCGACTCC CTCATTCGGCAACTGTGGCTCTGATGCTGCCGGCGTGAGCTGCTGCCAGAGCACGCAGTA CTGCCAACCTTGGAACGCCAACTACTACCAGTGCCTCGATCTCCCTGCTAAATGCGCTCA GCAGTTCCCGAACGTCGACTTCAATGGAGACGACATCCAGACCATCTACGGCATTCAGCC CGGAGAATGCTGCACGCGCTGCAGCGAGACTGCTGGTTGCAAGGCCTACACCTTCGTGAA CAGCAATCCGGGCCAACCGGCGTGCTACCTGAAGAGCGGCACTGGTACAAGGACGCCCTC GGTTGGAGCAGTCTCGGGCATCTTGACGGGAACGTCAACAACCCCGACGCCGACCCCAAC AATGACGCCAACGCCAACGCCGACGACATCATCGCCAACCTGCACCACGGCACCGTATGG CTCCTGTGGCTCCAGTAACGGAGCTACGTGCTGCCCGAGCGGCTACTACTGCCAACCATG GAACGACAGTTTTTACCAGTGCATCCAGCCGCCAGCGAAATGCTCGAAACAACTCACCGA CAAGGACTACTACGGCAACGACATTAAGACCGTCTACGTGAGCCTCCCGTCGCTTTGCTG TGATGCCTGTGCTAGCACGGCAGGATGCAAGGCGTACACGTACATCAACAACAACCCCGG TCAGCCTGTGTGCTACTTGAAGAGCGCTGCGGGAACTGCCACCACCAAGATCGGTGCTGT GTCGGGGACTCTCAACTAAGTTGAGACAGAAAGCAAACAGCTTGTAGTTTCCAATCTAACGCAAGCTCACGGTTGCCAT
