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Revision as of 17:05, 23 January 2012

Contents 1 Master 1 - MABS 1.1 Evolution Moléculaire 1.2 Math 1.3 Traitement de données biologiques 1.4 Fouille de données 1.5 Harmonisation des Connaissances, partie Bioanalyse 2 Master 2 MABS parcours Bioinformatique et Biologie des Systèmes 3 Licence 3 Bioanalyse - MABS et BCP 4 INSA 5 Master Pro Diagnostique 6 C2I 7 Licence 2 - Automatisation d'Analyses de Données Biologiques (ED4BIORM)

Master 1 - MABS

Evolution Moléculaire

• Ressources pédagogiques

• TD 1
• TD 3

Math

• TD Calcul matriciel
• TD Modélisation
• Documents relatifs aux ACP
• TD Probabilités

Traitement de données biologiques

• TD Transcriptome : Gènes différentiellement exprimés avec R/Bioconductor
• TD Transcriptome : clustering de profils d'expression

Fouille de données

Support de cours:

• Introduction et Généralités
• Classification, prédiction et caractérisation
• Clustering
• Règles d'association

Sujets de TD

• TD Classification et validation croisée

Projet

• Enoncé du projet

Harmonisation des Connaissances, partie Bioanalyse

• TD1 : Interrogation des banques de données
• TD2 : Analyse de séquences I: recherche par similarité, alignements deux à deux
• TD3 : Analyse de séquences II: alignements multiples et profils

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Master 2 MABS parcours Bioinformatique et Biologie des Systèmes

• TD Annotation Artemis
• Cours transcriptome
• TD transcriptome

• Cours Clustering
• M2P Bioinfo - Projet Data mining
• M2P Bioinfo - Projet Transcriptome

• Génome de E. coli de 2002 http://silico.biotoul.fr/enseignement/m2pro-bioinfo/EcolA01.embl

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Licence 3 Bioanalyse - MABS et BCP

• TD1 : Interrogation des banques de données
• TD2 : Comparaison de deux séquences
• TD3 : Analyse de séquences et Biologie Moléculaire
• TD4 : Analyse d'une famille de protéines
• TD5 : Analyse évolutive

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INSA

• TD1 : Banque et manipulation de séquences
• TD2 : Recherche par similarité de séquences, alignements multiples et profils

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Master Pro Diagnostique

• TD n°1 : Démarche pour identification de régions pour design de sondes

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C2I

• L3 Licence Pluridisciplinaire 2011_2012

Extraits_Cours_2011_2012

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Licence 2 - Automatisation d'Analyses de Données Biologiques (ED4BIORM)

Calendrier : Cours Magistral (CM) le lundi 7h45-9h45 en 1A-A13 et Travaux Pratiques (TP) le mardi de 13h30 à 17h30

• CM1 23/01
• CM2 06/02
• CM3 20/02
• CM4 27/02
• TP1 28/02
• CM5 12/03
• TP2 13/03 en U2-209
• CM6 19/03
• TP3 27/03 en U2-209
• CM7 02/04
• TP4 17/04 en U2-209

Supports de cours :

• Introduction