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= Master 1 - MABS =
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== Evolution Moléculaire (EM7BMAAM) ==
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== Licence 2 Biologie - Automatisation d'Analyses de Données Biologiques (ED4BIORM) ==
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* [http://silico.biotoul.fr/enseignement/m1-mabs/EvolMol/ Ressources pédagogiques]
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'''Calendrier :''' Cours Magistral (CM) le lundi 7h45-9h45 en '''1A-A13''' et Travaux Pratiques (TP) le mardi de 13h30 à 17h30
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* CM1 23/01
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== Licence 3 Biologie - Bioanalyse - MABS et BCP (EL6BIOFM) ==
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* TD2 : [[Bioanalyse_TD_Comparaison_de_deux_sequences|Comparaison de deux séquences]]
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* TD4 : [[Bioanalyse_TD_Analyse_d_une_famille_de_proteines|Analyse d'une famille de protéines]]
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== Licence 3 Informatique - UE d'ouverture Bioinformatique ==
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=== Evolution Moléculaire (EM7BMAAM) ===
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* [http://silico.biotoul.fr/enseignement/m1-mabs/EvolMol/TD1/ TD 1]
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* [[silico:enseignement/m1-mabs/EvolMol/TD1/|TD 1]]
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* [http://silico.biotoul.fr/enseignement/m1-mabs/EvolMol/TD3/index.html TD 3]
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* [http://silico.biotoul.fr/enseignement/transcriptome.pdf Cours transcriptome]
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== Mathématique pour la Biologie (EM7BBSDM) ==
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=== Mathématique pour la Biologie (EM7BBSDM) ===
* [[M1 MABS BBS Math TD Calcul Matriciel|TD]] Calcul matriciel
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* [[M1 MABS BBS Math TD Modelisation|TD]] Modélisation
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* [[M1 MABS BBS Math TD Proba|TD]] Probabilités
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== Traitement de données biologiques (EM7BMACM) ==
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=== Traitement de données biologiques (EM7BMACM) ===
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* [[Media:Transcriptome.pdf|Transcriptome]]
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* [[M1 MABS TDB TD Transcriptome - Clustering|TD]] Transcriptome : clustering de profils d'expression
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== Fouille de données (EM7BBSCM) ==
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=== Fouille de données (EM7BBSCM) ===
'''Support de cours:'''
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* [[Media:Data Mining - Intro.pdf|Introduction et Généralités]]
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* [[M1 MABS BBS Data Mining Projet|Enoncé]] du projet
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== Harmonisation des Connaissances, partie Bioanalyse ==
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=== Harmonisation des Connaissances, partie Bioanalyse ===
*TD1 : [[Interrogation des banques de données]]
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*TD2 : [[Analyse de séquences I: recherche par similarité, alignements deux à deux]]
*TD2 : [[Analyse de séquences I: recherche par similarité, alignements deux à deux]]
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== Traitement de graphes et réseaux biologiques (EM8BBSDM) ==
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=== Traitement de graphes et réseaux biologiques (EM8BBSDM) ===
'''Support de cours:'''  
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* [[Media:Graphes - Definitions et parcours.pdf|Généralités sur les graphes et réseaux]]
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= Master 2 MABS parcours Bioinformatique et Biologie des Systèmes =
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* [[Media:Transcriptome.pdf|Transcriptome]]
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* [http://silico.biotoul.fr/enseignement/m2pro-bioinfo/Annotation.html TD Annotation Artemis]
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== Master 2 - MABS parcours Bioinformatique et Biologie des Systèmes ==
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* [[silico:enseignement/m2pro-bioinfo/Annotation.html|TD Annotation Artemis]]
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* [[Media:Transcriptome.pdf|Cours transcriptome]]
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* [[Media:Data Mining - Clustering.pdf|Cours Clustering]]
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* [[M2P Bioinfo - Projet Transcriptome]]
* [[M2P Bioinfo - Projet Transcriptome]]
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* Génome de ''E. coli'' de 2002 http://silico.biotoul.fr/enseignement/m2pro-bioinfo/EcolA01.embl
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* Génome de ''E. coli'' de 2002 [[silico:enseignement/m2pro-bioinfo/EcolA01.embl|EcolA01.embl]]
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= Licence 3 Bioanalyse - MABS et BCP (EL6BIOFM) =
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== Master 2 Pro - Diagnostique ==
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* TD1 : [[Bioanalyse_TD_Interrogation_des_banques_de_donnees|Interrogation des banques de données]]
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* TD2 : [[Bioanalyse_TD_Comparaison_de_deux_sequences|Comparaison de deux séquences]]
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* [[silico:enseignement/m2pro-diag/TD1_tutorial_2011.html|TD n°1 : Démarche pour identification de régions pour design de sondes]]
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* TD3 : [[Bioanalyse_TD_Analyse_de_sequences_et_Biologie_Moleculaire|Analyse de séquences et Biologie Moléculaire]]
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* TD4 : [[Bioanalyse_TD_Analyse_d_une_famille_de_proteines|Analyse d'une famille de protéines]]
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* TD5 : [[Bioanalyse_TD_Analyse_evolutive|Analyse évolutive]]
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= INSA =
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* TD1 : [[Bioanalyse_TD_Banques_et_Manipulation_de_Sequences|Banque et manipulation de séquences]]
* TD1 : [[Bioanalyse_TD_Banques_et_Manipulation_de_Sequences|Banque et manipulation de séquences]]
* TD2 : [[Bioanalyse_TD_Banques_et_Manipulation_de_Sequences#Analyse_de_la_famille_prot.C3.A9ique|Recherche par similarité de séquences, alignements multiples et profils]]
* TD2 : [[Bioanalyse_TD_Banques_et_Manipulation_de_Sequences#Analyse_de_la_famille_prot.C3.A9ique|Recherche par similarité de séquences, alignements multiples et profils]]
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= M1 BioSanté =
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== C2I ==
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== Génomique humaine et animale (EM8BMCAM) ==
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= Master Pro Diagnostique =
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* [http://silico.biotoul.fr/enseignement/m2pro-diag/TD1_tutorial.html TD n°1 : Démarche pour identification de régions pour design de sondes]
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= C2I =
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* L3 Licence Pluridisciplinaire 2011_2012
* L3 Licence Pluridisciplinaire 2011_2012
[[media:C2i_LP_2011_2012.pdf|Extraits_Cours_2011_2012]]
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= Licence 2 - Automatisation d'Analyses de Données Biologiques (ED4BIORM) =
 
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'''Calendrier :''' Cours Magistral (CM) le lundi 7h45-9h45 en 1A-A13 et Travaux Pratiques (TP) le mardi de 13h30 à 17h30
 
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* CM1 23/01
 
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* CM2 06/02
 
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* CM3 20/02
 
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* CM4 27/02
 
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* TP1 28/02
 
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* CM5 12/03
 
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* TP2 13/03 en U2-209
 
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* CM6 19/03
 
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* TP3 27/03 en U2-209
 
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* CM7 02/04
 
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* TP4 17/04 en U2-209
 
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'''Supports de cours :'''
 
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* [[Media:L2 AADB Intro.pdf|Introduction]]
 
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* [[Media:L2 Elements image numerique.pdf|Elements sur les images numériques]]
 

Revision as of 10:59, 31 January 2012

Contents

Licence

Licence 2 Biologie - Automatisation d'Analyses de Données Biologiques (ED4BIORM)

Calendrier : Cours Magistral (CM) le lundi 7h45-9h45 en 1A-A13 et Travaux Pratiques (TP) le mardi de 13h30 à 17h30

  • CM1 23/01
  • CM2 06/02
  • CM3 20/02
  • CM4 27/02
  • TP1 28/02 en 4TP2-M6
  • CM5 12/03
  • TP2 13/03 en U2-209
  • CM6 19/03
  • TP3 27/03 en U2-209
  • CM7 02/04
  • TP4 17/04 en U2-209


Supports de cours :


Licence 3 Biologie - Bioanalyse - MABS et BCP (EL6BIOFM)


Licence 3 Informatique - UE d'ouverture Bioinformatique


Master

Master 1 - MABS

Evolution Moléculaire (EM7BMAAM)

Mathématique pour la Biologie (EM7BBSDM)

  • TD Calcul matriciel
  • TD Modélisation
  • Documents relatifs aux ACP
  • TD Probabilités

Traitement de données biologiques (EM7BMACM)

Support de cours:

Support de TD:

  • TD Transcriptome : Gènes différentiellement exprimés avec R/Bioconductor
  • TD Transcriptome : clustering de profils d'expression

Fouille de données (EM7BBSCM)

Support de cours:

Sujets de TD

  • TD Classification et validation croisée

Projet

Harmonisation des Connaissances, partie Bioanalyse


Traitement de graphes et réseaux biologiques (EM8BBSDM)

Support de cours:



Master 1 - BioSanté

Génomique humaine et animale (EM8BMCAM)

Support de cours:


Master 2 - MABS parcours Bioinformatique et Biologie des Systèmes


Master 2 Pro - Diagnostique


Autres

INSA


C2I

  • L3 Licence Pluridisciplinaire 2011_2012

Extraits_Cours_2011_2012



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