Enseignements
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Contents |
Licence
Licence 2 Biologie - Automatisation d'Analyses de Données Biologiques (ED4BIORM)
Calendrier : Cours Magistral (CM) le lundi 7h45-9h45 en 1A-A13 et Travaux Pratiques (TP) le mardi de 13h30 à 17h30
- CM1 23/01
- CM2 06/02
- CM3 20/02
- CM4 27/02
- TP1 28/02 en 4TP2-M6
- CM5 12/03
- TP2 13/03 en U2-209
- CM6 19/03
- TP3 27/03 en U2-209
- CM7 02/04
- TP4 17/04 en U2-209
Supports de cours :
- Introduction
- Elements sur les images numériques et ImageJ
- Applications et méthodologies d'acquisition d'images
Travaux pratiques :
- TP1: Initiation à Image J : Support de TP
Les images nécessaires pour le TP seront fournies pendant la séance.
Licence 3 Biologie - Bioanalyse - MABS et BCP (EL6BIOFM)
Supports de cours :
- Introduction
- banques et bases de données biologiques
- Alignement de deux séquences d'acides nucléiques
- Alignement de deux séquences protéiques
- Recherche par similarité dans les banques de données : la suite Blast
Annales :
Supports de TD :
Licence 3 Informatique - UE d'ouverture Bioinformatique
Supports de cours:
- Introduction à la biologie
- Introduction à la bioinformatique
- Alignement de deux séquences d'acides nucléiques
- Alignement de génomes
Supports de TD:
- TD1 : Séquences et banques de données
- TD2 : Introduction à BioPerl
- TD3 : Alignement de séquences
- TD4 : Analyse d'une souche pathogène émergente d'Escherichia coli
Master
Master 1 - MABS
Evolution Moléculaire (EM7BMAAM)
Mathématique pour la Biologie (EM7BBSDM)
Traitement de données biologiques (EM7BMACM)
Support de cours:
Support de TD:
- TD Transcriptome : Gènes différentiellement exprimés avec R/Bioconductor
- TD Transcriptome : clustering de profils d'expression
Fouille de données (EM7BBSCM)
Support de cours:
- Introduction et Généralités
- Classification, prédiction et caractérisation
- Clustering
- Règles d'association
Sujets de TD
- TD Classification et validation croisée
Projet
- Enoncé du projet
Harmonisation des Connaissances, partie Bioanalyse
- TD1 : Interrogation des banques de données
- TD2 : Analyse de séquences I: recherche par similarité, alignements deux à deux
- TD3 : Analyse de séquences II: alignements multiples et profils
Traitement de graphes et réseaux biologiques (EM8BBSDM)
Support de TD/TP:
- TP Visualisation et parcours en profondeur
Master 1 - BioSanté
Génomique humaine et animale (EM8BMCAM)
Support de cours :
Supports de TD :
- Analyse de données d'expression la séance du 14 février 2012 est reportée au mardi 21 février 13h30 en salle 4TP2-M6.
Master 2 - MABS parcours Bioinformatique et Biologie des Systèmes
- Génome de E. coli de 2002 EcolA01.embl
Master 2 Pro - Diagnostique
Autres
INSA
- TD1 : Banque et manipulation de séquences
- TD2 : Recherche par similarité de séquences, alignements multiples et profils
C2I
- L3 Licence Pluridisciplinaire 2011_2012
